質問
ストーリーを進めてしまうと取り返しがつかなくなることはあるでしょうか。
回答
これまでのドラクエシリーズ比較して、ドラクエ１１において特に取り返しがつかない、ということはありません。
なので、それほど気にせずストーリーを進めて大丈夫です。
とはいえ、（ストーリーではありませんが）やり直しができないことはあります。
以下の通りです。
別ハード間での完全なデータ移行はできない
PS4版、3DS版、そしておそらくニンテンドースイッチ版の間で、データの完全な移行・同期はできません。
そのため、プレイするハードは先に決めておく必要があります。
参考：［ドラクエ１１］異なるハード間のデータ同期
主人公の名前は後から変更できない
あなたの分身である主人公の名前は、後から変更できません。
適当に名前をつけたり、記入ミスをすると後悔することになるので、注意しましょう。
なお、「ふっかつのじゅもん」を入力して始めた場合も、名前の変更はできません。
ドラクエ１やドラクエ２の「ふっかつのじゅもん」を使った場合でも同様です。
参考：［ドラクエ１１］ふっかつのじゅもんの主人公名
しばりプレイの追加、解除後の戻し
「しばりプレイ」はゲーム開始時の主人公の名前をきめるところで、どのしばりプレイを行うか選択できますが、後から追加することはできません。
また、「しばりプレイ」は、ゲーム中いつでも解除できますが、解除後、再び「しばりプレイ」状態に戻すこともできません。